Ngày 9/12/2004, Thủ tướng Chính phủ ban hành Chỉ thị số 46/2004/CT-TTg về việc quản lý xe công nông tham gia giao thông đường bộ. Bộ Công an tổ chức đăng ký cấp biển số cho xe công nông đã sản xuất trước ngày 31/12/2004 là ngày Chỉ thị này có hiệu lực.
Thời gian thực hiện đăng ký xe công nông đến hết ngày 28/12/2005. Để thực hiện nghiêm Chỉ thị số 46, Tổng cục cảnh sát đã có công văn hướng dẫn một số điểm trong quản lý đăng ký xe công nông, trong đó có quy định hồ sơ của chủ phương tiện phải có Biên bản kiểm tra của ngành Giao thông vận tải chứng nhận xe công nông đủ điều kiện về an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường. VR đã có văn bản gửi các đơn vị đăng kiểm xe cơ giới tiến hành lập hồ sơ kiểm tra chất lượng, an toàn kỹ thuật và bảo vệ môi trường cho xe công nông để làm cơ sở đăng ký phương tiện.